mRNA | Plasmid standard | Primers and probe | |
---|---|---|---|
 Hbz | JA662 | 5′ Primer | [HBZMAP1] 5′-1905CTTCTAAGGATAGCAAACCGTCAAG1881-3′ |
 |  | Probe | [TMP-13] 5′-/56-FAM/1782CCTGTGCCA/ZEN/TGCCCGGAGGA1801/3IABkFQ/-3′ |
 |  | 3′ Primer | [HBZMAP2] 5′-353ATGGCGGCCTCAG365^1765GGCT1768-3′ |
 rGAPDH | rGAPDH | 5′ Primer | [rGAPDH-S] 5′-GATGCTGGTGCCGAGTACGTG-3′ |
 |  | Probe | [BY-1Z] 5′-/56-FAM/ACCACCATG/ZEN/GAGAAGGCCGGG/3IABkFQ/-3′ |
 |  | 3′ Primer | [rGAPDH-AS] 5′- GTGGTGCAGGATGCGTTGCTGA-3′ |
 Gag/Pol | ACHneo | 5′ Primer | [#20] 5′-938AGCCCCCAGTTCATGCAGACC958-3′ |
 |  | Probe | [TMP-3] 5′-/56-FAM/990CTGCCAAAG/ZEN/ACCTCCAAGACCTCC1013/3IABkFQ/-3′ |
 |  | 3′ Primer | [#19] 5′-1036GAGGGAGGAGCAAAGGTACTG1016-3′ |
Gene | |||
 Gag/Pol | ACHneo | 5′ Primer | [#20] 5′-938AGCCCCCAGTTCATGCAGACC958-3′ |
 |  | Probe | [TMP-3] 5′-/56-FAM/990CTGCCAAAG/ZEN/ACCTCCAAGACCTCC1013/3IABkFQ/-3′ |
 |  | 3′ Primer | [#19] 5′-1036GAGGGAGGAGCAAAGGTACTG1016-3′ |
Region of interest | Plasmid standard | Primers | |
---|---|---|---|
vCTCF-BS | NA | 5′ Primer | [CTCF-F2] 5′-6826TAGCACTATGCTGTTTCGCCT6846-3′ |
 |  | 3′ Primer | [CTCF-R2] 5′-7211GGTGGACGGGCTATTATCTT7192-3′ |